Từ tháng 10 năm 2010 đến tháng 6 năm 2012, ông đã huấn luyện đội tuyển bóng đá quốc gia Campuchia.[1] Kể từ tháng 7 năm 2013, ông lại là huấn luyện viên trưởng của đội U-15 Campuchia.[2][3]

Ông Lee Tae-hoon làm việc ở Campuchia từ tháng 8/2010 cho đến tháng 3/2017, dẫn dắt ĐTQ nước này tổng cộng 45 trận, thắng 16, hòa 4, thua 24, thành tích tốt nhất trong các đời HLV.

Năm 2019, V-League 2019 ông trở thành HLV trưởng Hoàng Anh Gia Lai sau khi làm Giám đốc kĩ thuật mùa giải 2018-2019 và quay lại vị trí giám đốc kĩ thuật vào ngày 28/9/2020 sau trận thua 0-2 trước Sông Lam Nghệ An trên sân Vinh tại vòng 12 V-League 2020.